犬传染性生殖器肿瘤（Canine transmissible venereal tumors， CTVT）是目前全世界范围内仅有的3种哺乳动物传染性肿瘤之一，同时也是最古老的肿瘤细胞系。 张亚平团队与古脊椎动物与古人类研究所付巧妹团队前期研究发现CTVT作为肿瘤“活化石”，记录了从郊狼到北美土著家犬的古老渐渗（Wang et al., Cell Research, 2019），提示了该肿瘤基因组的复杂性。虽然早期罹患肿瘤动物（CTVT founder）的体细胞突变已被充分解析，但肿瘤基因组本身遗传变异特征仍鲜有研究。
为了进一步确认CTVT基因组遗传变异对肿瘤进展的影响，以及对于人类肿瘤学研究是否具有借鉴意义，中科院昆明动物所张亚平团队和王国栋团队开展合作，利用44个国家543个CTVT全基因组或外显子组公共数据，确认了中国南方CTVT属于早期肿瘤谱系，很可能是从俄罗斯-乌克兰地区传入。根据全球CTVT系统发育关系，分析出了CTVT的早期结构变异（structural variation，SVs）事件，并进一步结合三代转录组测序数据证实了由此产生的11个胚系基因融合（germline gene fusions，GGFs），其中包含1个复杂基因融合“Greedy Fusion”——HSD17B4-DMXL1-TNFAIP8。通过与33种人类肿瘤跨物种比较，发现了这些GGFs显示出更高的遗传易感性，并且在肿瘤退化期显示出下调特征，与DNA甲基化水平有关，突出了CTVT作为肿瘤模型的研究价值。
本研究于近日在线发表于国际期刊iScience， 周博闻博士和云南大学生态与环境学院吴青琴博士为共同第一作者； 张亚平研究员、王国栋研究员和柳延虎副研究员为共同通讯作者；四川大学华西医院和公安部昆明警犬基地等多个单位提供了协助。该项工作得到了国家重点研发计划、科技创新2030、昆明市春城计划、云南省基础研究计划、国家自然科学基金和中国科学院青年创新促进会等支持。
文章链接：https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(23)02508-7#secsectitle0020
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